IBI-5023 Organização e evolução dos sistemas biológicos


Responsáveis:

Profa Dra Helaine Carrer

Depto. De Cências Biológicas, ESALQ, USP

hecarrer@esalq.usp.br, fone (19)3429-4344

Prof Dr Sergio Russo Matioli

Depto de Biologia, IB, USP

srmatiol@ib.usp.br, fone (11)3091-7552

 

Objetivos:

O curso pretende mostrar, aos alunos com formação de graduação em Ciências exatas, a maneira como os sistemas biológicos são organizados e especialmente como o conhecimento sobre esses sistemas é obtido, dentro de uma perspectiva evolucionista.

Organização da aula:


1a. parte, aula expositiva sobre o assunto e entrega do questionário.

2a. parte, seminários de alunos e discussão sobre texto previamente fornecido.

 

Avaliação:

Média da nota dos questionários (mínimo de 8) (50%)

Nota da apresentação (20%)

Participação em aulas e nas discussões (30%)

Cronograma:


Aula 1: 07/03 Introdução e aspectos da história da Biologia. S

Aula 2: 14/03 Epistemologia da Biologia. Prof. Convidado: Dr Ruy Sergio Murrieta. Texto I. Questionário 1

Aula 3: 21/03 Semana santa, não haverá aula.

Aula 4: 28/03 Principios básicos de Biologia molecular. H.Texto II a e Texto IIb: Questionário 2 Texto III: Questionário 3

Aula 5: 04/04 Princípios básicos de Genética.Texto IVa e texto IVb: Questionário 4

Aula 6: 11/04 Estrutura genética de populações. H. Texto Va e Vb: Questionário 5

Aula 7: 18/04 Genética quantitativa. S. Texto VIa e VIb: Questionário 6

Aula 8: 25/04 Seleção natural e adaptações. H. Texto VIIa e VIIb: Questionário 7

Aula 9: 02/05 Tecidos, órgãos e sistemas vegetais. H. Texto VIII a e VIIIb: Questionário 8

Aula 10: 09/05 Principios de fisiologia vegetal. H. Texto IXa e IXb: Questionário 9 (sobre o texto IXc >>>novo<<<<)

Aula 11: 16/05 Organização e funcionamento do corpo animal. S. Somente aula.

Aula 12: 23/05 Embriologia Texto Xa e Xb: Questionário 10

Aula 13: 30/05 Ecologia. S. Texto XIa e XIb: Questionário 11

Aula 14: 06/06 Evolução molecular. S. Texto XIIa e XIIb: Questionário 12

Aula 15: 13/06 Filogenias moleculares. S. Texto XIIIa e XIIIb: Questionário 13

Aula 16: 20/06 Evolução genômica. S. Texto XIVa e XIVb: Questionário 14

 

Bibliografia geral

Cooper, G.M. (2000) The Cell, a molecular approach.

Wen-Hsiung Li (1997) Molecular Evolution. Sinauer Associates.

Matioli, S.R. (2001). Biologia molecular e evolução. Holos, Ribeir‹o Preto.

Mayr, E. (1989). The growth of biological though. Harvard University Press, Harvard.

Ridley, M. (1996) Evolution. Sinauer. Sunderland.

Bibliografia específica

Texto I: Hallvard Lillehammer. 2003. Biology and Philosophy. Debunking morality: evolutionary naturalism and moral error theory.

Texto IIa: Blanchard, J.L. & Linch, M.2000. Organelar Genes: Why do they end up in the nucleus? TIG, vol.16, Nº7:

Texto IIb: Selosse, M. et al., 2001. Reducing the genome size of organelles favours gene transfer to the nucleus. Trends in Ecology & Evolution. Vol. 16, Nº 3.

Texto III: Jianzhi Zhang. 2003. Evolution by gene duplication: un update. Trends in Ecology and Evolution. V. 18, Nº6.

Texto IVa: R.C. Lewontin. 2002. Directions in Evolutionary Biology. Ann. Rev. Genet. 36:1-18

Texto IVb: Jarle Breivik. 2005. The evolutionary origin of genetic Instability in cancer development. Seminars in Cancer Biology. 15:51-60.

Texto Va : Daniel J. Wilson, Daniel Falush and Gilean McVean. 2005. Germ, genomes and genealogies. Trends in Ecology and Evolution. Vol 20, Nº1.

Texto Vb: John J. Welch and David Waxman. 2005. The nk model and population genetics. Journal of Theoretical Biology. 234:329-340.

Texto VIa: Jack W. Sites Jr and Jonathon C. Marshall. 2004. Operational Criteria for Delimiting Species. Ann. Rev. Ecol. Syst. 35:199-227.

Texto VIb: Kaiser. 2001. Building a Multicellular Organism. Annu. Rev. Genet. 35:103-23.

Texto VIIa: Hisaji Maki. 2002. Origins of Spontaneous Mutations: Specificity and Directionality of Base-substitution, Frameshift, and Sequence-Substitution Mutageneses. Ann. Rev. Genet. 36:279-303.

Texto VIIb: Sharon Y. Strauss and Rebecca E. Irwin. 2004. Ecological and Evolutionalry Consequences of Multispecies Plant-Animal Interactions. Ann. Rev. Ecol. Evol.Syst. 35:435-66.

Texto VIIIa: Richard B. Meagher et al. 1999. The evolution of new structures. Trends in Genetics vol15, Nº7.

Texto VIIIb: Nicola A. Ramsay e Beverley J. Glover. 2005. MYB-bHLH-WD40 protein complex and the evolution of cellular diversity. Trends in Plant Science. Vol 10, Nº2.

Texto IXa: Ian R. Henderson, Chikako Shindo and Caroline Dean. 2003. The need for Winter in the Switch to Flowering. Ann. Rev. Genet. 37:371-92.

Texto IXb: Jonathan M. Levine and David J. Murrell. 2003. The Community-Level Consequences of Seed Dispersal Patterns. Annu. Rev. Ecol. Syst. 34:549-74

Texto Xa: Gardner, R. L. 2002. Stem Cells: Potency, plasticity and public perception. J. Anat. 200:277-282.

Texto Xb: Robert Sablowski. 2004. Plant and animal stem cells: conceptually similar, molecularly distinct? Trends in cell Biology. Vol 14 Nº11

Texto XIa: Christian S. Riesenfeld et al. 2004. Metagenomics: Genomic Analysis of Microbial Communities. Annu. Rev. Genet. 38:525-52.

Texto XIb: Diana Pilson and Holly R. Prendeville. 2004. Ecological Effects of Transgenic Crops and the Escape of Transgenic into Wild Populations. Ann. Rev. Ecol. Evol. Syst. 35:149-74.

Texto XIIa: I. King Jordan et al. 2005. Evolutionary significance of gene expresión divergence. Gene. 345:119-126

Texto XIIb: Evgeniy S. Balakirev and Francisco J.Ayala. 2003. Pseudogenes: Are they "junk" or Functional DNA? Ann. Rev. Genet. 37:123-51

Texto XIIIa: Ted Twnsend and Allan Larson. 2002. Molecular Phylogenetics and Mitochondrial Genomics Evolution in the Chamaeleonidae (Reptilia, Squamata). Molecular Phylogenetics and Evolution. Vol. 23, Nº1: 22-36.

Texto XIIIb: William Martin et al. 2005 (in press). Chloroplast genome phylogenetics: why we need independet approaches to plant molecular evolution. Trends in Plant Science.

Texto XIVa: David M. Rand et al. 2004. Cytonuclear coevolution: the genomics of cooperation. Trends in Ecol. And Evolution. Vol 19, Nº12.

Texto XIVb: Richard R. Copley et al. 2001. Genome and Protein Evolution in Ecukaryotes. Current Opinion in Chemical Biology. 6:39-45.