Questionario 13

Texto XIIIa: Ted Twnsend and Allan Larson. 2002. Molecular Phylogenetics and Mitochondrial Genomics Evolution in the Chamaeleonidae (Reptilia, Squamata). Molecular Phylogenetics and Evolution. Vol. 23, Nº1: 22-36.

1. defina:
a) cadeia leve
b) clado
c) evento vicariante
d) fixação do microcomplemento
e) grupo externo
f) homoplasia
g) monofilia
h) politomia
i) sinapomorfia
j) viviparidade

2. Os autores utilizam a filogenia molecular de parte do genoma mitocondrial como âncora para a inferência de eventos evolutivos de camaleões. Quais são os dados analizados molecularmente e quais são os eventos evolutivos considerados?

3. Quais são as contribuições do estudo em relação às inferências filogenéticas realizadas anteriormente?

Texto XIIIb: William Martin et al. 2005 (in press). Chloroplast genome phylogenetics: why we need independet approaches to plant molecular evolution. Trends in Plant Science.

4. Quais são os desvios das premissas normalmente consideradas nos programas de computador normalmente utilizados  que são tratados no artigo? Como tais desvios afetam as inferências filogenéticas?

5. Para um determinado esforço em termos de seqüenciamento para a inferência de filogenias existe um compromisso na amostragem: mais táxons e seqüências mais curtas ou menos táxons e seqüências mais longas. Cite algumas vantagens e desvantagens das duas estratégias.